5 ноября 2006 года Архиепископ Новой Юстинианы и всего Кипра Хризостом II был избран Предстоятелем Кипрской Православной Церкви. 12 ноября 2006 года, состоялась интронизация  Архиепископа Хризостома.

По случаю годовщины интронизации и дня тезоименитства Блаженнейшего Архиепископа Хризостома Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий направил Его Блаженству поздравительное послание, в котором говорится: «Верим, что поставление Ваше свершилось предстательством великого светильника и вселенского учителя, имя которого Вы носите, святителя Иоанна Златоуста».

Предстоятель Русской Церкви назвал знаменательным то, что в этом году празднование дня тезоименитства Архиепископа Хризостома совпало с 1600-летием преставления святителя Иоанна, память которого широко празднуется во всем православном мире.

Святейший Патриарх пожелал Архиепископу Хризостому «неоскудевающей милости Божией, крепости телесной и духовной для продолжения высокого Предстоятельского служения».

Патриархия.ru