31 июля 2009 г. по приглашению руководства Управления исполнения наказаний по Томской области секретарь Томской епархии протоиерей Алексий принял участие в мероприятиях, посвященных 74 годовщине основания 2-ой Воспитательной колонии для совершивших тяжкие преступления несовершеннолетних девочек.
В Российской Федерации таких колоний существую всего три. В Томской колонии содержатся девочки, совершившие тяжкие преступления на территории 36 субъектов Федерации — от Урала до Чукотки. С этим учреждением у Томской епархии уже на протяжении многих лет сложились добрые взаимоотношения. С 1998 г. колонию окормляют священнослужители Свято-Троицкой церкви г. Томска. В выделенном помещении совершаются богослужения, организована воскресная школа. На Пасху и Рождество Христово воскресная школа Свято-Троицкой церкви проводит в колонии праздничные концерты.
С осени 2005 г. на территории учреждения, силами Свято-Троицкой церкви г. Томска, начато возведение деревянного храма во имя Анастасии Узорешительницы. Лес для строительства храма был выделен постановлением губернатора области, а все столярные работы были выполнены заключенными колонии №3. Освятить храм планируется летом 2010 года.
Отец Алексий обратился с приветственным словом к руководству УИН и колонии, осужденным девочкам. Он напомнил, что эти девочки ― молодежь, за которой будущее страны. Они станут чьими-то женами — хранительницами семейных очагов, станут мамами, что именно к такому будущему нужно им себя готовить невзирая ни на какие трудности. «Ничего не бояться: создавать семьи, рожать детей — такие труды благословляет Господь», — сказал отец Алексий.
«Православие в Томске»/Патриархия.ru